Кафедра клинической фармакологии была организована в 1989 году. С 1998 до 2001 года Клиническая фармакология функционировала как курс при кафедре Фармакологии, затем при Госпитальной педиатрии-II и с 2001 года вновь реорганизована в кафедру Клинической фармакологии. С 2012 года Клиническая фармакология функционирует как курс при кафедре«ВОП терапия». Заведовали кафедрой: В 1983году заведующий курсом доцент Г.Г.Гулямов. С 1984-1988 гг. заведующий курсом и с 1988-1998гг. заведующим кафедрой Клинической фармакологии профессор В.З.Мазгутов. С 1988-1999 года заведующим кафедрой Фармакологии и курсом Клинической фармакологии была профессор С.С.Азизова. С 1999-2000 года заведующим кафедрой Госпитальной педиатрии-II и курсом Клинической фармакологии - профессор С.А.Рахимов. С 2001 года заведующей кафедрой. С 2012 года по настоящее время заведующей курсом Клинической фармакологии является доцент Н.В.Агзамова.

На кафедре работали ассистент Ахмедова Г.Х. (1998-2005)., ассистент Бахранов С.Я. (2003-2006)., ассистент Носирова Н.И. (2006-2010)., ассистент Ташпулатова Г.Н. (2003-2014)., ассистент Хасаншина Т.Л. (2015-2017).